复旦大学软件学院依托复旦大学深厚的学术底蕴和充沛的办学资源，以建设一流特色化软件学院为目标，围绕新型平台软件等开展高水平科学研究，坚持走产学研相结合道路，以科研进展带动教学，把握行业和学科发展的最新动向，并把创新科研成果充实到教学实践，建立起富有创新精神的教师队伍。

学院近年来在学科建设上取得诸多进展：多人多次在顶尖国际学术会议上发表论文；人均科研经费持续多年保持在50万元以上；获得多项国家级人才称号；培养的博士生获得全国百篇优博；先后有青年教师获得“上海IT青年十大新锐”和“上海市浦江学者”等称号。

学院现有上海市数据科学重点实验室、软件工程实验室、数据分析与安全实验室、系统软件与安全实验室、电子商务研究中心、并行处理研究所、交互式图形学实验室和复旦大学公共绩效与信息化研究中心等研究机构。